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Andrew Oates


Andrew 'Andy' Charles Oates (né en 1969 à Adélaïde, Australie) est un biologiste du développement et un embryologiste australien et britannique. Il est professeur à l'EPFL (École Polytechnique Fédérale de Lausanne) et responsable du laboratoire Segmentation Timing and Dynamics à la faculté des sciences de la vie de l'EPFL[1] - [2] - [3]. Il occupe depuis 2021 le poste de doyen de la Faculté des sciences de la vie de l'EPFL[4].

Andrew Charles Oates
Description de cette image, également commentée ci-après
Andy Oates dans son laboratoire en 2020
Naissance
Nationalité Australie, Royaume-Uni
Domaines Biologie du développement
Institutions École Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL)
DiplĂ´me Biochimie
Formation Université d'Adélaïde, Université de Melbourne
Directeur de thèse Andrew F. Wilks
Site https://www.epfl.ch/labs/oateslab/

Carrière

Oates obtient en 1992 un diplôme en biochimie avec mention pour son travail au laboratoire Robert Saint de l'Université d'Adélaïde. Il obtient un doctorat dans le laboratoire d'Andrew F. Wilks au Ludwig Institute for Cancer Research et à l'Université de Melbourne en 1998[5], avant de poursuivre un stage postdoctoral dans le laboratoire de Robert Ho conjointement à l'Université de Princeton et à l'Université de Chicago, où il commence ses travaux sur la temporalité de la segmentation chez le poisson zèbre[6]. En 2003, il rejoint l'Institut Max Planck de biologie cellulaire moléculaire et génétique de Dresde pour établir son groupe de recherche[7] - [8]. Il devient professeur de génétique du développement des vertébrés au University College de Londres en 2012 et transfère son groupe à l'Institut national pour la recherche médicale de Mill Hill à Londres[9]. En avril 2015, il devient membre de l'Institut Francis Crick à Londres[10].

En 2016, il rejoint l'EPFL en tant que professeur ordinaire, où il fonde et dirige le laboratoire Timing, Oscillation, Patterns à la Faculté des Sciences de la Vie de l'EPFL[1] - [2] - [3].

Depuis 2018, il est directeur de l'Institut de bio-ingénierie de l' EPFL[11]. Il devient doyen de la Faculté des sciences de la vie de l'EPFL en 2021[4].

Recherche

Le laboratoire d'Andrew Oates est composé de biologistes, d'ingénieurs et de physiciens. Il s'appuie sur la génétique moléculaire, l'imagerie quantitative et l'analyse théorique dans le but d'étudier dans les embryons de vertébrés certaines populations couplées d'oscillateurs génétiques, appelées horloges de segmentation[12]. Ces systèmes orchestrent la formation rythmique et séquentielle des segments corporels embryonnaires[13] - [14].

Ces travaux ont contribué à une meilleure compréhension de l'implication de ces gènes dans le rythme de la segmentation et ont mené à établir que ce rythme implique également des processus physiques et collectifs à des échelles multicellulaires et tissulaires[15] - [16].

Distinctions

Oates est membre de la British Society of Developmental Biology[17]. Il est reçoit le prix RK Mortenson de biochimie en 1991.

Publications notables

Références
  1. « Brexit: closer cooperation with the UK cannot replace participation in Horizon 2020 | ETH-Board », www.ethrat.ch (consulté le )
  2. (en-GB) « oateslab », www.epfl.ch (consulté le )
  3. « Andrew Charles Oates », people.epfl.ch (consulté le )
  4. EPFL Magazine, « Nouveaux doyens pour SB et SV », sur epfl.ch, (consulté le )
  5. (en) Nicholson, Oates, Harpur et Ziemiecki, « Tyrosine kinase JAK1 is associated with the granulocyte-colony-stimulating factor receptor and both become tyrosine-phosphorylated after receptor activation. », Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 91, no 8,‎ , p. 2985–2988 (ISSN 0027-8424, PMID 7512720, PMCID 43499, DOI 10.1073/pnas.91.8.2985, lire en ligne)
  6. (en) Oates, Bruce et Ho, « Too Much Interference: Injection of Double-Stranded RNA Has Nonspecific Effects in the Zebrafish Embryo », Developmental Biology, vol. 224, no 1,‎ , p. 20–28 (PMID 10898958, DOI 10.1006/dbio.2000.9761, lire en ligne)
  7. (en) Schröter, Herrgen, Cardona et Brouhard, « Dynamics of zebrafish somitogenesis », Developmental Dynamics, vol. 237, no 3,‎ , p. 545–553 (PMID 18265021, DOI 10.1002/dvdy.21458, lire en ligne)
  8. (en) Uriu, Ares, Oates et Morelli, « Dynamics of mobile coupled phase oscillators », Physical Review E, vol. 87, no 3,‎ , p. 032911 (ISSN 1539-3755, DOI 10.1103/PhysRevE.87.032911, lire en ligne)
  9. (en) Soroldoni, Jorg, Morelli et Richmond, « A Doppler effect in embryonic pattern formation », Science, vol. 345, no 6193,‎ , p. 222–225 (ISSN 0036-8075, PMID 25013078, DOI 10.1126/science.1253089, lire en ligne)
  10. « King's College London - Randall Seminar: Professor Andrew Oates », www.kcl.ac.uk (consulté le )
  11. Hillary Sanctuary, « Andrew Oates, la passion pour les cycles », sur epfl.ch, (consulté le )
  12. (en) Naganathan et Oates, « Mechanochemical coupling and developmental pattern formation », Current Opinion in Systems Biology, vol. 5,‎ , p. 104–111 (DOI 10.1016/j.coisb.2017.09.007, lire en ligne)
  13. (en-GB) « Research », www.epfl.ch (consulté le )
  14. Lleras Forero, Narayanan, Huitema et VanBergen, « Segmentation of the zebrafish axial skeleton relies on notochord sheath cells and not on the segmentation clock », eLife, vol. 7,‎ , e33843 (ISSN 2050-084X, PMID 29624170, DOI 10.7554/eLife.33843, lire en ligne)
  15. (en) Oates, « Waiting on the Fringe: cell autonomy and signaling delays in segmentation clocks », Current Opinion in Genetics & Development, vol. 63,‎ , p. 61–70 (PMID 32505051, DOI 10.1016/j.gde.2020.04.008, lire en ligne)
  16. (en) Venzin et Oates, « What are you synching about? Emerging complexity of Notch signaling in the segmentation clock », Developmental Biology, vol. 460, no 1,‎ , p. 40–54 (PMID 31302101, DOI 10.1016/j.ydbio.2019.06.024, lire en ligne)
  17. « Newsletter », British Society for Developmental Biology

Liens externes
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