Alteromonadaceae
Les Alteromonadaceae forment une famille de bactéries à Gram négatif, de l'embranchement des Pseudomonadota. Cet ordre est contient les bactéries du genre Alteromonas.
| RĂšgne | Bacteria |
|---|---|
| Embranchement | Pseudomonadota |
| Classe | Gammaproteobacteria |
| Ordre | Alteromonadales |
Genres de rang inférieur
- Aestuariibacter
- Agaribacter
- Alteromonas, genre type
Taxonomie
Ătymologie
La famille Alteromonadaceae a Ă©tĂ© nommĂ©e ainsi d'aprĂšs le genre type qui lui a Ă©tĂ© assignĂ©, Alteromonas[2] - [3]. Son Ă©tymologie est la suivante : Al.te.ro.mo.na.daâce.ae N.L. fem. n. Alteromonas, genre type de la famille; L. fem. pl. n. suff. -aceae, suffixe signifiant famille; N.L. fem. pl. n. Alteromonadaceae, la famille des Alteromonas [2] - [3] - [4].
Historique
La famille Alteromonadaceae a Ă©tĂ© dĂ©crite en pour regrouper dans une mĂȘme famille les genres de ProtĂ©obactĂ©ries marines Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina et Colwellia sur la base de leurs homologies de sĂ©quences ARNr 16S[2], ces espĂšces forment un clade monophylĂ©tique[2]. En , lors de la description de l'ordre Alteromonadales dans le Bergey's Manual, la famille Alteromonadaceae y est intĂ©grĂ©e comme unique famille de cet ordre[3] et la mĂȘme annĂ©e dans la liste des nouveaux noms n°106 sĂ©parĂ©e en plusieurs familles[5].
Liste des genres
Selon la LPSN (19 septembre 2022)[6], la famille des Alteromonadaceae compte 27 genres publiées de maniÚre valide :
- Aestuariibacter, depuis
- Agaribacter, depuis
- Alteromonas, genre type depuis la description de la famille en 2001[2].
- Marinobacter
Description
Lors de sa description de , la famille Alteromonadaceae reprend la description des Alteromonadales. C'est-Ă -dire qu'elle est composĂ©e de bactĂ©ries Ă Gram nĂ©gatif avec des bacilles Ă morphologie droite ou incurvĂ©e et mobiles par l'intermĂ©diaire d'un flagelle polaire unique[3]. Ces bacilles ne forment pas d'endospores ni de kystes. La majeure partie des bactĂ©ries de cette famille sont des chimiohĂ©tĂ©rotrophes soit anaĂ©robies facultatifs soit aĂ©robies stricts et qui utilisent l'oxygĂšne comme accepteur d'Ă©lectrons[3]. La plupart des bactĂ©ries de cette famille sont catalase et oxydase positives. Il existe diffĂ©rents types de rĂ©gimes de croissance : psychrophiles, psychrotolĂ©rants et mĂ©sophiles. La plupart des espĂšces nĂ©cessitent des ions sodium pour leur croissance et cette croissance est optimale dans des milieux Ă base d'eau de mer. La source d'azote peut ĂȘtre de l'ammoniaque[3]. Le Coenzyme Q majoritaire est l'ubiquinone-8[3].
Le pourcentage en bases nucléotidiques GC de l'ADN est situé entre 36 % et 54 54% en [3].
En général, ce ne sont pas des bactéries pathogÚnes[3].
Habitats
Les bactéries de la famille des Alteromonadaceae sont des bactéries marines. Elles peuvent résider dans différents écosystÚmes marins tels que les eaux de surface ou la glace marine ou les sédiments des abysses[3].
Notes et références
- Ivanova et Mikhailov 2001, p. 10.
- Ivanova et Mikhailov 2001, p. 15.
- Bowman et McMeekin 2005, p. 443.
- (en) « Family Alteromonadaceae », sur LPSN,
- (en) Jean EuzĂ©by, « Validation List no. 106. Validation of publication of new names and new combinations previously effectively published outside the IJSEM », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, IUMS, vol. 55,â , p. 2235â2238 (DOI 10.1099/ijs.0.64108-0)
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 19 septembre 2022
Bibliographie
- (en) John P. Bowman et Thomas A. McMeekin, « Order X. Alteromonadales ord. nov. », dans Brenner Don J., Krieg Noel R., Staley James T., Garrity GM (eds), Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, vol. 2 (The Proteobacteria), part B (The Gammaproteobacteria), New York, Springer, , p. 443
- (en) E.P. Ivanova et V.V. Mikhailov, « A New Family, Alteromonadaceae fam. nov., Including Marine Proteobacteria of the Genera Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina, and Colwellia », Microbiology, vol. 70,â , p. 10â17 (DOI 10.1023/A:1004876301036)
- (ru) E.P. Ivanova et V.V. Mikhailov, « A New Family, Alteromonadaceae fam. nov., Including Marine Proteobacteria of the Genera Alteromonas, Pseudoalteromonas, Idiomarina, and Colwellia », Microbiologiia, vol. 70,â , p. 15-23
Liens externes
- Ressources relatives au vivant :
- Global Biodiversity Information Facility
- (en) EPPO Global Database
- (mul + en) iNaturalist
- (en) Interim Register of Marine and Nonmarine Genera
- (en) List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
- (en + en) New Zealand Organisms Register
- (en) SystÚme d'information taxonomique intégré
- (en) World Register of Marine Species
- Ressource relative à la santé :