Accueil🇫🇷Chercher

SOAPdenovo

SOAPdenovo est un logiciel d'assemblage de novo de courtes séquences d'ADN produites par un séquenceur de gènes [1]. Cet outil fait partie de la suite logicielle SOAP (Short Oligonucleotide Analysis Package)[2].

SOAPdenovo

Historique

SOAPdenovo a été développé en 2009 par l'Institut de génomique de Pékin. Ce logiciel a été utilisé pour la première fois dans un projet visant à assembler de novo la séquence du génome humain, et ce, de manière rapide et économique[3]. Le même logiciel fut utilisé un an plus tard pour assembler, de la même façon, le génome du panda géant[4].

Notes et références

  1. Illumina GA
  2. BGI Americas Bioinformatics Software
  3. Li R, Zhu H, Ruan J et al., De novo assembly of human genomes with massively parallel short read sequencing. Genome Research FĂ©v 20(2), 2009, p. 265-272.
  4. Li R, Fan W, Tian G et al. (2010) The sequence and de novo assembly of the giant panda genome. Nature 463:311-317.

Voir aussi

Liens externes

Cet article est issu de wikipedia. Text licence: CC BY-SA 4.0, Des conditions supplémentaires peuvent s’appliquer aux fichiers multimédias.