Nomenclature des gènes de levure
Le nom des gènes de levure contient 3 lettres et jusqu’à 3 chiffres : RHO1, RAD21… Le choix de ces 3 lettres est souvent lié à la fonction du gène.
Choix des lettres
Gène sauvage
Le gène sauvage est écrit en majuscule et en italique : RHO1, RAD21.
Gène à mutation récessive
Les gènes portant une mutation récessive sont écrits en minuscule et en italique : rho1, rad21.
Allèles mutants
Les allèles mutants sont représentés par un tiret et un nombre : rho1-23, rad21-456.
Protéine
Le produit d’un gène (la protéine) est écrit avec une lettre majuscule suivie de deux minuscules sans italique. Un p est souvent ajouté à la fin : Rho1p, Rad21p
Autres
Enfin, de nombreux gènes identifiés lors du séquençage du génome restent sans fonction connue. Ils sont nommés YDR518C, YML016W..., avec:
- Y pour yeast
- La deuxième lettre désigne le chromosome (D=IV, M=XIII....)
- L ou R désigne le bras droit (Right) ou gauche (Left) du chromosome.
- Les trois chiffres correspondent au n° du cadre de lecture ouvert (ORF) compté à partir du centromère.
- C et W indiquent si l’ORF est transcrite sur le brin Crick ou Watson
Notes et références
Cet article est issu de wikipedia. Text licence: CC BY-SA 4.0, Des conditions supplémentaires peuvent s’appliquer aux fichiers multimédias.