Domaine EGF
Un domaine EGF, ou domaine EGF-like, EGF-like domain en anglais, est un domaine protéique, conservé à travers l'évolution, appelé ainsi en référence au facteur de croissance épidermique (Epidermal Growth Factor en anglais), protéine où ce type de structure a été décrit pour la première fois. Il est formé de 30 à 40 résidus d'acides aminés et a été observé dans un grand nombre de protéines, essentiellement animales[3] - [4]. La plupart des occurrences de domaines EGF ont été observées dans les domaines extracellulaires des protéines membranaires ou dans les protéines sécrétées (en). La cyclooxygénase 2 fait exception.
Les domaines EGF contiennent six résidus de cystéine qui, dans le facteur de croissance épidermique, forment trois ponts disulfure. La structure de domaines EGF à quatre ponts disulfure a été résolue dans des laminines et des intégrines. La principale structure d'un domaine EGF est un feuillet β à deux brins suivi par une boucle jusqu'à un second feuillet β C-terminal plus court, également à deux brins. Ces deux feuillets β sont généralement désignés comme feuillet majeur côté N-terminal et feuillet mineur côté C-terminal[5].
Les domaines EGF sont généralement présents dans les protéines en exemplaires multiples adjacents : ces répétitions tendent à se replier ensemble pour constituer un solénoïde linéaire formant une unité fonctionnelle.
Notes et références
- (en) K. Nagata, D. Kohda, H. Hatanaka, S. Ichikawa, S. Matsuda, T. Yamamoto, A. Suzuki et F. Inagaki, « Solution structure of the epidermal growth factor-like domain of heregulin-α, a ligand for p180erbB-4 », The EMBO Journal, vol. 13, no 15,‎ , p. 3517-3523 (PMID 8062828, PMCID 395255, lire en ligne)
- (en) Jian-Ping Xiong, Thilo Stehle, Beate Diefenbach, Rongguang Zhang, Reinhardt Dunker, David L. Scott, Andrzej Joachimiak, Simon L. Goodman et M. Amin Arnaout, « Crystal Structure of the Extracellular Segment of Integrin αVβ3 », Science, vol. 294, no 5541,‎ , p. 339-345 (PMID 11546839, PMCID 2885948, DOI 10.1126/science.1064535, Bibcode 2001Sci...294..339X, lire en ligne)
- (en) A. K. Downing, V. Knott, J. M. Werner, C. M. Cardy, I. D. Campbell et P. A. Handford, « Solution Structure of a Pair of Calcium-Binding Epidermal Growth Factor-like Domains: Implications for the Marfan Syndrome and Other Genetic Disorders », Cell, vol. 85, no 4,‎ , p. 597-605 (PMID 8653794, DOI 10.1016/S0092-8674(00)81259-3, lire en ligne)
- (en) Peer Bork, A. Kristina Downing, Bruno Kieffer et Iain D. Campbell, « Structure and distribution of modules in extracellular proteins », Quarterly Reviews of Biophysics, vol. 29, no 2,‎ , p. 119-167 (PMID 8870072, DOI 10.1017/S0033583500005783, lire en ligne)
- (en) Merridee A. Wouters, Isidore Rigoutsos, Carmen K. Chu et Lina L. Feng, « Evolution of distinct EGF domains with specific functions », Protein Science, vol. 14, no 4,‎ , p. 1091-1103 (PMID 15772310, DOI 10.1110/ps.041207005, Bibcode 2253431, lire en ligne)