Déséquilibre de liaison

On s'intéresse aux gamètes créées dans une population à reproduction sexuée. On note ${\displaystyle p_{A}}$ la fréquence d'apparition de l'allèle A sur un locus (${\displaystyle p_{A}}$ est la proportion de gamètes ayant l'allèle A sur ce locus). Sur un autre locus, l'allèle B apparaît avec une fréquence ${\displaystyle p_{B}}$. La proportion de gamètes ayant à la fois A et B est notée ${\displaystyle p_{AB}}$.

Lorsque l'association entre A et B est aléatoire (c'est-à-dire quand A et B sont indépendants au sens statistique), la fréquence d'association des gamètes A et B est donnée par le produit ${\displaystyle p_{AB}=p_{A}p_{B}}$. Il y a déséquilibre de liaison lorsque ${\displaystyle p_{AB}}$ diffère de ${\displaystyle p_{A}p_{B}}$.

Le niveau de déséquilibre de liaison entre A et B est quantifié par le coefficient de déséquilibre de liaison ${\displaystyle D_{AB}}$ défini par

${\displaystyle D_{AB}=p_{AB}-p_{A}p_{B}}$

L'indice "AB" de ${\displaystyle D_{AB}}$ indique de le déséquilibre de liaison est une propriété de la paire d'allèles {A, B}, et non pas une propriété de leurs loci respectifs. D'autres paires d'allèles sur ces deux mêmes loci peuvent avoir des valeurs de coefficient de déséquilibre de liaison différentes.

• (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Linkage disequilibrium » (voir la liste des auteurs).