Chimiokine
Les chimiokines (parfois appelées, par anglicisme, chémokines[1]) sont une famille de petites protéines, majoritairement solubles, de 8-14 kilodaltons. Les chimiokines sont des cytokines chimiotactiques qui contrôlent les motifs de migration et le positionnement des cellules immunitaires. Leur fonction la plus étudiée est l'attraction (chimiotactisme) et le contrôle de l'état d'activation des cellules du système immunitaire. D'autres fonctions leur ont été aussi attribuées, dans le développement embryologique ou la physiologie du système nerveux par exemple. Elles sont caractérisées par la présence de quatre résidus cystéine en des positions conservées nécessaires à la formation de leur structure tridimensionnelle.
Les chimiokines sont retrouvées chez tous les vertébrés, certains virus et certaines bactéries, mais aucune n'a encore été décrite chez les invertébrés.
Histoire
Historiquement, ces protéines ont été connues sous d'autres noms comme la famille SIS des cytokines, la famille SIG des cytokines, la famille SCY des cytokines, la superfamille du facteur-4 plaquettaire ou les intercrines.
Classification
Chimiokines CC | |||
Name | Gene | Autre(s) nom(s) | Uniprot |
CCL1 | Scya1 | I-309, TCA-3 | P22362 |
CCL2 | Scya2 | MCP-1 | P13500 |
CCL3 | Scya3 | MIP-1α | P10147 |
CCL4 | Scya4 | MIP-1β | P13236 |
CCL5 | Scya5 | RANTES | P13501 |
CCL6 | Scya6 | C10, MRP-2 | P27784 |
CCL7 | Scya7 | MARC, MCP-3 | P80098 |
CCL8 | Scya8 | MCP-2 | P80075 |
CCL9/CCL10 | Scya9 | MRP-2, CCF18, MIP-1γ | P51670 |
CCL11 | Scya11 | Eotaxin | P51671 |
CCL12 | Scya12 | MCP-5 | Q62401 |
CCL13 | Scya13 | MCP-4, NCC-1, Ckβ10 | Q99616 |
CCL14 | Scya14 | HCC-1, MCIF, Ckβ1, NCC-2, CCL | Q16627 |
CCL15 | Scya15 | Leukotactine-1, MIP-5, HCC-2, NCC-3 | Q16663 |
CCL16 | Scya16 | LEC, NCC-4, LMC, Ckβ12 | O15467 |
CCL17 | Scya17 | TARC, dendrokine, ABCD-2 | Q92583 |
CCL18 | Scya18 | PARC, DC-CK1, AMAC-1, Ckβ7, MIP-4 | P55774 |
CCL19 | Scya19 | ELC, Exodus-3, Ckβ11 | Q99731 |
CCL20 | Scya20 | LARC, Exodus-1, Ckβ4, MIP-3α | P78556 |
CCL21 | Scya21 | SLC, 6Ckine, Exodus-2, Ckβ9, TCA-4 | O00585 |
CCL22 | Scya22 | MDC, DC/β-CK | O00626 |
CCL23 | Scya23 | MPIF-1, Ckβ8, MIP-3, MPIF-1 | P55773 |
CCL24 | Scya24 | Eotaxine-2, MPIF-2, Ckβ6 | O00175 |
CCL25 | Scya25 | TECK, Ckβ15 | O15444 |
CCL26 | Scya26 | Eotaxine-3, MIP-4α, IMAC, TSC-1 | Q9Y258 |
CCL27 | Scya27 | CTACK, ILC, Eskine, PESKY, skinkine | Q9Y4X3 |
CCL28 | Scya28 | MEC | Q9NRJ3 |
Chimiokines CXC | |||
Name | Gene | Other name(s) | Uniprot |
CXCL1 | Scyb1 | Gro-α, GRO1, NAP-3 | P09341 |
CXCL2 | Scyb2 | Gro-β, GRO2, MIP-2α | P19875 |
CXCL3 | Scyb3 | Gro-γ, GRO3, MIP-2β | P19876 |
CXCL4 | Scyb4 | PF-4 | P02776 |
CXCL5 | Scyb5 | ENA-78 | P42830 |
CXCL6 | Scyb6 | GCP-2 | P80162 |
CXCL7 | Scyb7 | NAP-2, CTAPIII, β-Ta, PEP | P02775 |
CXCL8 | Scyb8 | IL-8, NAP-1, MDNCF, GCP-1 | P10145 |
CXCL9 | Scyb9 | MIG, CRG-10 | Q07325 |
CXCL10 | Scyb10 | IP-10, CRG-2 | P02778 |
CXCL11 | Scyb11 | I-TAC, β-R1, IP-9 | O14625 |
CXCL12 | Scyb12 | SDF-1, PBSF | P48061 |
CXCL13 | Scyb13 | BCA-1, BLC | O43927 |
CXCL14 | Scyb14 | BRAK, bolekine | O95715 |
CXCL15 | Scyb15 | Lungkine, WECHE | Q9WVL7 |
CXCL16 | Scyb16 | SRPSOX | Q9H2A7 |
CXCL17 | VCC-1 | DMC, VCC-1 | Q6UXB2 |
Chimiokines C | |||
Name | Gene | Autre(s) nom(s) | Uniprot |
XCL1 | Scyc1 | Lymphotactine α, SCM-1α, ATAC | P47992 |
XCL2 | Scyc2 | Lymphotactine β, SCM-1β | Q9UBD3 |
Chimiokines CX3C | |||
Name | Gene | Autre(s) nom(s) | Uniprot |
CX3CL1 | Scyd1 | Fractalkine, Neurotactine, ABCD-3 | P78423 |
Les chimiokines sont classées en quatre sous-familles en fonction de l'espacement entre deux de leurs cystéines en position N-terminale :
- La famille CXC ou alpha, dont les membres possèdent un acide aminé entre les deux premières cystéines.
- La famille CC ou beta, dont les membres possèdent deux premières cystéines adjacentes
- La famille CX3C ou delta, dont l'unique membre (la Fractalkine) possède trois acides aminés entre les deux premières cystéines.
- La famille C ou gamma, dont les deux uniques membres (Lymphotactine alpha et beta) ne possèdent que 2 cystéines (le 2e et le 4e résidu)
Rôles biologiques
Toutes les chimiokines exercent leurs fonctions en se fixant sur des récepteurs couplés aux protéines G. Certaines chimiokines sont considérées comme pro-inflammatoires. La sécrétion de ces chimiokines peut être induite lors de la réponse immune afin de favoriser l'arrivée de cellules du système immunitaire au niveau d'un site infectieux (notamment en activant l'intégrine des phagocytes). D'autres chimiokines sont impliquées dans le contrôle de la migration de cellules au cours des processus de maintenance tissulaire ou au cours du développement. Une chimiokine particulière, la fractalkine, est exprimée sous la forme d'une protéine membranaire et présente certaines propriétés dans l'adhérence cellulaire. Cependant, son clivage membranaire est possible libérant la protéine soluble pour une action paracrine.
Notes et références
- Dictionnaire de l’Académie de médecine, “Chémokine”. http://dictionnaire.academie-medecine.fr/search/results?titre=ch%C3%A9mokine