NeuGRID

À travers une identification personnelle au «Science Gateway», l'utilisateur à accès au laboratoire virtuel de résonances magnétiques. Dans ce portail les utilisateurs peuvent charger, utiliser, et partager des algorithmes pour l'analyse de résonance magnétiques cérébrales, avoir accès à des grandes archives de résonances magnétiques cérébrales, et faire des analyses statistiques intensives, toujours supportés par un centre d'assistance spécialisé et par le biais de matériel informatif. Grâce à une série de services distribués et à des ressources statistiques basées sur des systèmes grid/cloud, les analyses ont subi une accélération sans précédent par rapport aux analyses de laboratoires traditionnelles. Les potentialités de neuGRID ont été testées en 2009, et le résultat a donné l'extraction d'un biomarqueur de la maladie d'Alzheimer (épaisseur cortical 3D avec Freesurfer et CIVET) dans deux semaines de temps au lieu de cinq années, le temps nécessaire pour les normales analyses de laboratoire.

Le projet neuGRID a été financé par la Commission européenne DG INFSO à travers le 7^e Programme Cadre de 2008 à 2011. L'infrastructure de neuGRID a été développée pendant cette période. La deuxième phase du projet a été financée toujours par la Commission Européenne, cette fois DG CONNECT, avec le projet neuGRIDforyou (N4U), visant à étendre les services aux utilisateurs de neuGRID avec une interface nouvelle et plus intuitive. Le projet N4U terminera en décembre 2014.

Le Consortium initial de neuGRID comprenait huit partenaires européens de Italie, France, Grande-Bretagne, Pays Bas, Suède, Espagne et Suisse. N4U implique 9 partenaires européens (6 déjà dans le consortium de neuGRID) et deux partenaires de l'Amérique du Nord. Les partenaires internationaux ont été impliqués encore une fois grâce à un financement européen de la DG INFSO (outGRID, www.outgrid.eu). Le coordinateur des trois projets est Giovanni B. Frisoni, neurologue à l'IRCCS Fatebenefratelli, Centre National pour la Maladie d'Alzheimer à Brescia, Italie.

Sur l'infrastructure

• Frisoni GB, Redolfi A, Manset D, Rousseau MÉ, Toga A, Evans AC. Virtual imaging laboratories for marker discovery in neurodegenerative diseases. Nat. Rev. Neurol. (Paris) 2011;7:429-38.
• Redolfi A, McClatchey R, Anjum A, Zijdenbos A, Manset D, Barkhof F, Spenger C, Legré Y, Wahlund L, Barattieri di San Pietro C, Frisoni GB. Grid infrastructures for computational neuroscience: the neuGRID example. Future Neurology 2009;4:703-22.
• Barkhof F. Making better use of our brain MRI research data. Eur Radiol 2012;22:1395-6.
• Anjum A, Bloodsworth P, Habib I, Lansdale T, McClatchey R, Mehmood Y; neuGRID Consortium. Reusable services from the neuGRID project for grid-based health applications. Stud Health Technol Inform 2009;147:283-8.

études neuroscientifiques où neuGRID a été utilisé comme ressource

• Redolfi A, Bosco P, Manset D, Frisoni GB, neuGRID Consortium. Brain investigation and brain conceptualization. Functional Neurology; 2013; Vol.28(3): 175-190.
• Cover KS, van Schijndel RA, van Dijk BW, Redolfi A, Knol DL, Frisoni GB, Barkhof F, Vrenken H; neuGRID Consortium; Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative. Assessing the reproducibility of the SienaX and Siena brain atrophy measures using the ADNI back-to-back MP-RAGE MRI scans. Psychiatry Res 2011;193:182-90.
• Frisoni GB, Fox N, Jack C Jr, Scheltens P, and Thompson PM. The clinical use of structural MRI in Alzheimer disease Nat Rev. Neurol. (Paris) 2010; 6:67–77.

La démonstration neuGRID a récemment obtenu le prix la meilleure démonstration (Best Live Demonstration) à la conférence EGEE’09[1] (Enabling Grid for E-SciencE), qui a eu lieu à Barcelone, Espagne et celui du 5^e EGEE User Forum[2] qui s’est déroulé à Uppsala, Suède.

• Imagerie médicale
• Grille informatique

• Site officiel du projet neuGRID
• neuGRID video (demo) - en anglais