Faustovirus
Faustovirus (FSTV) est un genre de virus géant à ADN bicaténaire présentant quelques similarités avec les Asfarviridae ou les Mimiviridae[1]. En 2022, ce virus n'est pas classé par l'ICTV.
| Type | Virus |
|---|---|
| Domaine | Varidnaviria |
| Règne | Bamfordvirae |
| Embranchement | Nucleocytoviricota |
| Famille | incertae sedis |
— auteur incomplet —, date à préciser
Il infecte l'amibe Vermamoeba vermiformis[2] associées aux humains.
Le virus a été isolé pour la première fois en 2015[2] et s'est avéré avoir un diamètre d'environ 0,2 micromètre avec un génome d'ADN double brin de 466 kilobases censé coder 451 protéines. Bien que classés comme un virus nucléocytoplasmique à grand ADN (NCLDV), les Faustovirus partagent moins d'un quart de leurs gènes avec d'autres NCLDV ; cependant, environ 46 % sont homologues à des gènes bactériens et les autres sont des gènes orphelins (ORFans)[3]. Plus précisément, le gène codant la protéine de capside majeure (MCP) des Faustovirus est différent de celui du virus géant le plus proche, Asfivirus, ainsi que des autres NCLDV. Dans l'Asfivirus, le gène codant la MCP est un fragment génomique unique d'environ 2 000 paires de bases (pb)[4], alors que dans le Faustovirus, la MCP est codée par 13 exons séparés par 12 grands introns[5]. Les exons ont une longueur moyenne de 149 bp et les introns ont une longueur moyenne de 1 273 bp[5]. La présence d'introns dans les gènes de Faustovirus est atypique pour un virus[4].
Notes et références
- (en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Faustovirus » (voir la liste des auteurs).
- https://ictv.global/report/chapter/unclassified/unclassified-viruses
- Reteno DG, Benamar S, Khalil JB, Andreani J, Armstrong N, Klose T, Rossmann M, Colson P, Raoult D, La Scola B, « Faustovirus, an asfarvirus-related new lineage of giant viruses infecting amoebae », J Virol, vol. 89, no 13,‎ , p. 6585–94 (PMID 25878099, PMCID 4468488, DOI 10.1128/JVI.00115-15)
- Chatterjee A, Sicheritz-Pontén T, Yadav R, Kondabagil K, « Genomic and metagenomic signatures of giant viruses are ubiquitous in water samples from sewage, inland lake, waste water treatment plant, and municipal water supply in Mumbai, India », Scientific Reports, vol. 9, no 1,‎ , p. 3690 (PMID 30842490, PMCID 6403294, DOI 10.1038/s41598-019-40171-y, Bibcode 2019NatSR...9.3690C)
- Klose T, Reteno DG, Benamar S, Hollerbach A, Colson P, La Scola B, Rossmann MG, « Structure of faustovirus, a large dsDNA virus », Proc Natl Acad Sci U S A, vol. 113, no 22,‎ , p. 6206–11 (PMID 27185929, PMCID 4896704, DOI 10.1073/pnas.1523999113
) - Cherif Louazani A, Baptiste E, Levasseur A, Colson P, La Scola B, « Faustovirus E12 Transcriptome Analysis Reveals Complex Splicing in Capsid Gene », Frontiers in Microbiology, vol. 9,‎ , p. 2534 (PMID 30487777, PMCID 6247863, DOI 10.3389/fmicb.2018.02534 )