La saison 1938-1939 du Championnat de Tchécoslovaquie de football est la 15e édition du championnat de première division en Tchécoslovaquie. Les douze meilleurs clubs du pays se retrouvent au sein d'une poule unique, la First League, où les formations s'affrontent deux fois, à domicile et à l'extérieur.
Cette saison a été marquée par l'invasion du pays par les forces nazies, le . Cet événement a eu deux conséquences sur le déroulement de la I. Liga : l'ensemble des clubs slovaques sont exclus de la présente saison et la scission de la Tchécoslovaquie entre la Bohême-Moravie et la République slovaque entraîne la création de deux championnats distincts. Ainsi, le 1. CsSK Bratislava, seul club slovaque de l'élite, est exclu en , et participe donc à une compétition raccourcie avec d'autres clubs de République slovaque, le Championnat de République slovaque.
C'est le club de l'AC Sparta Prague, tenant du titre, qui termine à nouveau en tête du classement du championnat, avec un seul point d'avance sur le SK Slavia Prague et quatre sur le SK Pardubice. C'est le 6e titre de champion de Tchécoslovaquie de l'histoire du club.
Oldřich Nejedlý (21)