Abi prism collection

Abi prism collection est le logiciel chargé de faire la collecte des données brutes d'électrophorèse sur le séquenceur de gène Abi prism 310.

Le logiciel permet :

• de faire son plan de plaque : noms des échantillons et position sur la plaque
• de lancer l'électrophorèse

Le logiciel effectue le pilotage de l'instrument afin de collecter les données brutes. La séquence des opérations est :

• fermeture du canal du gel bloc du côté de la cuve de tampon,
• coulage d'un nouveau polymère dans le capillaire entre chaque échantillon en agissant sur le piston relié à la seringue de polymère au niveau du gel block. Le vieux polymère est jeté dans le tube poubelle en position trois,
• réouverture du canal du gel block,
• positionnement dans le tube de la plaque correspondant à l'échantillon suivant,
• électro-injection dans le tube,
• rinçage de l'électrode et du capillaire,
• lancement de l'électrophorèse,
• collecte des données d'électrophorèse au bout d'un temps préprogrammé,
• arrêt de la collecte au bout d'un autre temps préprogrammé (30 minutes généralement en gene scan ou 3 heures en séquence)
• appel du programme d'analyse des données (gene-scan analysis ou sequencing analysis)
• passage à l'échantillon suivant : le cycle recommence

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